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二代測序(next-generation sequencing, NGS)平臺介紹——Ion Personal Genome Machine(PGM™)測序儀
2015-10-08 09:56:33  來自:

  美國Life Technologies公司的Ion Personal Genome Machine(PGM?)測序儀是首款半導(dǎo)體測序儀,,是市場上相較其他測序技術(shù)更簡便快捷、經(jīng)濟(jì)和具有強(qiáng)大的可擴(kuò)展性的測序平臺,。PGM?臺式系統(tǒng)的設(shè)計(jì)配合革新性的半導(dǎo)體芯片技術(shù),,使整個平臺具有極高的擴(kuò)展性和快速完成測序的性能。

  一,、優(yōu)點(diǎn):

  1.更準(zhǔn)確:該系統(tǒng)通過檢測芯片內(nèi)反應(yīng)液H+含量進(jìn)行測序,,本底干擾低,明顯改善堿基判讀準(zhǔn)確性,。

  2.更快速:在24-48小時之內(nèi)可完成從取樣到結(jié)果輸出整個流程。

  3.成本低:由于該系統(tǒng)無需標(biāo)記熒光染料和化學(xué)發(fā)光等配套試劑,,測序成本低,。

  4.提供多種實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì):三種規(guī)格芯片、多種自動化解決方案和生物信息學(xué)分析,。

  二,、應(yīng)用領(lǐng)域:

  可進(jìn)行未知基因組序列的全新測序、已知序列再測序,、擴(kuò)增子或目標(biāo)片段測序,、拷貝數(shù)分析、甲基化分析,、轉(zhuǎn)錄組測序,、表達(dá)譜分析和染色質(zhì)免疫共沉淀和二代平臺的文庫質(zhì)量控制等眾多領(lǐng)域。在臨床上的應(yīng)用主要包括:

  1.腫瘤分子診斷領(lǐng)域:臨床醫(yī)生可根據(jù)患者的個體基因組信息進(jìn)行區(qū)分,,實(shí)施個性化診療工作,。如腫瘤熱點(diǎn)基因的變異篩查可以幫助臨床醫(yī)生對患者的腫瘤易感性、耐藥性的個性化的評估并進(jìn)行個性化治療,。

  2.遺傳病篩查領(lǐng)域:對于單基因遺傳病可以明確診斷,,對于多基因遺傳病,,通過基因突變篩查也可以明確診斷。

  3.產(chǎn)前診斷領(lǐng)域:可以對高危孕婦外周血血漿中的游離基因片段進(jìn)行基因測序,,對胎兒非整倍體疾病進(jìn)行無創(chuàng)性產(chǎn)前檢查和輔助診斷,。

  4.感染性疾病和公共衛(wèi)生監(jiān)測領(lǐng)域:不僅可以進(jìn)行感染性疾病的診斷,還可對病原微生物耐藥性位點(diǎn)進(jìn)行分析,;還可應(yīng)用于未知感染性疾病宏基因組學(xué)分析和傳染病監(jiān)控等方面,。

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