美國Molecular Devices公司的GenePixTM 4000B生物芯片掃描儀是世界上唯一能進行雙波長同步掃描的儀器，是基因表達譜芯片分析的良好配置。該儀器的技術核心是運用獨特的光學路徑結構，在五分鐘內(nèi)通過雙波長同步或者連續(xù)激光掃描，針對22x75mm矩陣反應信號的強度進行快速、并行、高效地檢測分析。
該儀器的優(yōu)勢在于：采用雙波長同步激光掃描方式，通過對光電倍增管和溫度控制等優(yōu)化，以達到好的信噪比值；可調整式焦距系統(tǒng)，精確度1微米。與儀器匹配的是一款全功能生物信息軟件GenePix Pro 7.0，該軟件容易操作，具有靈活、強大的基因表達分析系統(tǒng)，分析結果可隨時與芯片上的點互相對照連接，可以嚴謹?shù)奶崛】煽繑?shù)據(jù)。
主要應用領域包括：與各種疾病相關的SNP基因型分析及基因組雜交陣列分析；轉錄組學中的基因表達分析、RNAi分析、miRNA陣列；蛋白質組學中的蛋白質、多肽抗體、ELISA、反向陣列；表觀基因組學中的DNA甲基化分析、染色質免疫沉淀分析；以及新應用中的組織陣列、量子點分析、糖芯片分析、化合物陣列分析。
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