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二代測序(next-generation sequencing, NGS)平臺介紹——Ion Personal Genome Machine(PGM™)測序儀
2015-10-08 09:56:33  來自:

  美國Life Technologies公司的Ion Personal Genome Machine(PGM?)測序儀是首款半導體測序儀,是市場上相較其他測序技術更簡便快捷、經(jīng)濟和具有強大的可擴展性的測序平臺。PGM?臺式系統(tǒng)的設計配合革新性的半導體芯片技術,使整個平臺具有極高的擴展性和快速完成測序的性能。

  一、優(yōu)點:

  1.更準確:該系統(tǒng)通過檢測芯片內(nèi)反應液H+含量進行測序,本底干擾低,明顯改善堿基判讀準確性。

  2.更快速:在24-48小時之內(nèi)可完成從取樣到結果輸出整個流程。

  3.成本低:由于該系統(tǒng)無需標記熒光染料和化學發(fā)光等配套試劑,測序成本低。

  4.提供多種實驗設計:三種規(guī)格芯片、多種自動化解決方案和生物信息學分析。

  二、應用領域:

  可進行未知基因組序列的全新測序、已知序列再測序、擴增子或目標片段測序、拷貝數(shù)分析、甲基化分析、轉錄組測序、表達譜分析和染色質(zhì)免疫共沉淀和二代平臺的文庫質(zhì)量控制等眾多領域。在臨床上的應用主要包括:

  1.腫瘤分子診斷領域:臨床醫(yī)生可根據(jù)患者的個體基因組信息進行區(qū)分,實施個性化診療工作。如腫瘤熱點基因的變異篩查可以幫助臨床醫(yī)生對患者的腫瘤易感性、耐藥性的個性化的評估并進行個性化治療。

  2.遺傳病篩查領域:對于單基因遺傳病可以明確診斷,對于多基因遺傳病,通過基因突變篩查也可以明確診斷。

  3.產(chǎn)前診斷領域:可以對高危孕婦外周血血漿中的游離基因片段進行基因測序,對胎兒非整倍體疾病進行無創(chuàng)性產(chǎn)前檢查和輔助診斷。

  4.感染性疾病和公共衛(wèi)生監(jiān)測領域:不僅可以進行感染性疾病的診斷,還可對病原微生物耐藥性位點進行分析;還可應用于未知感染性疾病宏基因組學分析和傳染病監(jiān)控等方面。

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